El programa "Modernización del Estado, desarrollo productivo y uso sostenible de recursos naturales" persigue la meta de apoyar la implementación de una política integrada para el fomento de un desarrollo equitativo y sustentable. Los Estados de la región deben usar enfoques innovativos para formular, implementar y evaluar políticas sectorialmente integradas y acordadas entre las instancias estatales. Se trabaja en torno a 4 componentes

Componente 1 Gestión fiscal y territorial 

Componente 2 Fomento del desarrollo productivo

Componente 3 Gestión integral de recursos naturales para el desarrollo sostenible

Componente 4 Fondo para temas innovadores